Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMTNP53814 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMTNP53814 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMTNP53814 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMTNP53814 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMTNP53814 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMTNP53814 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMTNP53814 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms