Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF1P51825 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF1P51825 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF1P51825 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF1P51825 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFF1P51825 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFF1P51825 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFF1P51825 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFF1P51825 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFF1P51825 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms