Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFSP49914 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFSP49914 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms