Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms