Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIP4K2AP48426 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2AP48426 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms