Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME1P48163 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME1P48163 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME1P48163 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME1P48163 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME1P48163 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME1P48163 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms