Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB2P47870 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms