Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GALR1P47211 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms