Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCAMP43121 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCAMP43121 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCAMP43121 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms