Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPGP40121 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPGP40121 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPGP40121 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms