Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC8P31273 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms