Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF1P30408 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms