Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCSK1P29120 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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