Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXP28300 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXP28300 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXP28300 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms