Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTSSP25774 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTSSP25774 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTSSP25774 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTSSP25774 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTSSP25774 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms