Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRC1P22897 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRC1P22897 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRC1P22897 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRC1P22897 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRC1P22897 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms