Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKACBP22694 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms