Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGFR4P22455 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms