Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA2P17301 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms