Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2F2P13984 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms