Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms