Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL6A2P12110 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms