Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPD1P10809 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPD1P10809 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms