Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms