Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC166P0CW27 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms