Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3P05106 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms