Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYCNP04198 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYCNP04198 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYCNP04198 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYCNP04198 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 779.4 ms