Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL10P02778 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL10P02778 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms