Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC3P02656 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC3P02656 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOC3P02656 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms