Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD1O95696 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD1O95696 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD1O95696 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD1O95696 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRD1O95696 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD1O95696 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD1O95696 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD1O95696 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms