Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms