Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4AO75164 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms