Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNQ3O43525 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms