Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms