Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms