Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIEO00221 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms