Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCER2I3L3R5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms