Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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