Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms