Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3P2A8K0S8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms