Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RIMBP3BA6NNM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMBP3BA6NNM3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RIMBP3BA6NNM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms