Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED16Q9Y2X0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED16Q9Y2X0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms