Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LEMD3Q9Y2U8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LEMD3Q9Y2U8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms