Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF1Q9UMS5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms