Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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