Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH9Q9ULB4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms