Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN1Q9ULB1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN1Q9ULB1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms