Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms