Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRNDQ9UKY0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRNDQ9UKY0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms