Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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